По состоянию на 19 сентября 2013 уровень воды в верхнем бьефе Новосибирского водохранилища – 113, 26 м; уровень нижнего бьефа – 93,87 м; изменение уровня водохранилища за сутки – (+1) см, общий среднесуточный расход - 1435 м³/с, (в том числе: через турбины – 1430 м³/с, через водослив - 4 м³/с, на шлюзование – 1 м³/с).

Гидроэлектростанция работает в штатном режиме.

На ГЭС выполняется полный комплекс необходимых мероприятий по контролю уровней притока и обеспечению нормального функционирования гидротехнических сооружений. В постоянном режиме осуществляется информационный обмен и взаимодействие органов власти, МЧС, Верхне-Обского бассейнового водного управления, Новосибирского гидрометцентра.

Локальная система оповещения (ЛСО) Новосибирской ГЭС, состоящая из 8 объектов (выносных акустических устройств), находится в режиме постоянной готовности к передаче сигналов и информации оповещения. Сигналы готовы принять персонал станции, объектовые аварийно-спасательные формирования, дежурные службы организаций, население, проживающее в зоне действия ЛСО – протяженностью 6 км ниже плотины ГЭС.